Tako kot ribe, meso, jajca, mleko in druga živalska živila, soja vsebuje boljši beljakovinski in aminokislinski vzorec, ki je bolj v skladu s potrebami človeškega telesa in ima večjo hranilno vrednost.
Čepravsojine beljakovineje boljša beljakovina, vendar obstajajo boljše kot.Sojine beljakovineima manj esencialne aminokisline, imenovane metionin, ne le manj kot živalske beljakovine, ampak tudi manj kot nekatere žitne beljakovine. Če se soja uporablja kot krma za živino, je treba dodati nekaj meionina za zadovoljevanje potreb živine. Poleg tega jesojine beljakovineni stabilen, ki se izgubi pri predelavi sojinih izdelkov, kar ima za posledico neučinkovito vsebino. Zatosojine beljakovineima manj hranilne vrednosti kot kravje mlečne beljakovine (sirotkine beljakovine), jajčnih beljakovin ali mesnih beljakovin.
V bistvu, prednost soje ni, dasojine beljakovineje boljša od živalskih beljakovin, vendar soja in njeni izdelki ne vsebujejo holesterola, vsebnost maščob je nizka, in predvsem nenasičene maščobne kisline, to je redko in dragoceno za bolezni srca in ožilja, kot so debelost za preprečevanje in zdravljenje in hipertenzijo, nenormalne maščobe v krvi, koronarne bolezni srca. V ta namen je leta 1999 FDA proizvajalcem soje dovolila, da trdijo, da "sojine beljakovinelahko zmanjša tveganje za srčno bolezen" in da "jedo 25 gramovsojine beljakovinena dan v okviru diete z nizko vsebnostjo nasičenih maščob in holesterola lahko zmanjša tveganje za bolezni srca."
Poleg tega je soja ena izmed rastlinskih živil z visoko vsebnostjo beljakovin in dobro kakovostjo, bogata pa je z lyzinom, kar lahko izboljša celotno prehransko vrednost prehranske vrednosti s komplementarnim učinkom, ko jemo skupaj z žiti.
